79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1703 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 1034 aa  2117    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  90.71 
 
 		 1034 aa  1942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  50.19 
 
 		 1074 aa  897    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.4 
 
 		 428 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.82 
 
 		 626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.23 
 
 		 628 aa  152  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.79 
 
 		 632 aa  145  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  31.66 
 
 		 403 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.03 
 
 		 378 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  30.46 
 
 		 606 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.43 
 
 		 439 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.8 
 
 		 446 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.63 
 
 		 440 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 		 432 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 889 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.91 
 
 		 356 aa  102  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.11 
 
 		 824 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.14 
 
 		 1061 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 773 aa  94.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  28.03 
 
 		 429 aa  91.3  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  25.45 
 
 		 586 aa  91.3  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  30.48 
 
 		 821 aa  87.8  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.21 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  33.14 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  30.29 
 
 		 770 aa  75.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.86 
 
 		 414 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.86 
 
 		 414 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.86 
 
 		 414 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 262 aa  73.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  31.1 
 
 		 751 aa  72.8  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  29.95 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.89 
 
 		 379 aa  72  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.55 
 
 		 563 aa  72  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  29.44 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.24 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  28.24 
 
 		 666 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.93 
 
 		 557 aa  67  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  29.77 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  21.43 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  27.85 
 
 		 666 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  24.25 
 
 		 388 aa  61.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.11 
 
 		 386 aa  60.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.19 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.66 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  25 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  27.93 
 
 		 666 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  25.42 
 
 		 927 aa  55.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  26.63 
 
 		 918 aa  55.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  26.19 
 
 		 795 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  26.19 
 
 		 795 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  26.19 
 
 		 795 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  26.19 
 
 		 795 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  25.6 
 
 		 796 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  37.35 
 
 		 744 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  25.3 
 
 		 1045 aa  51.6  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  23.66 
 
 		 924 aa  51.6  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  25.9 
 
 		 795 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  25 
 
 		 796 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  27.56 
 
 		 507 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  25 
 
 		 796 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.52 
 
 		 568 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  26.63 
 
 		 795 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  39.68 
 
 		 747 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.37 
 
 		 559 aa  48.9  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.88 
 
 		 581 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.9 
 
 		 558 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.88 
 
 		 553 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  29.81 
 
 		 249 aa  46.2  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.15 
 
 		 581 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  28.4 
 
 		 795 aa  46.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  25.44 
 
 		 795 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  22.91 
 
 		 825 aa  45.8  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  24.84 
 
 		 945 aa  45.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  27.06 
 
 		 356 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.88 
 
 		 581 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  25.49 
 
 		 768 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  30.63 
 
 		 1067 aa  45.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  26.32 
 
 		 795 aa  45.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.41 
 
 		 631 aa  44.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>