241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1603 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  63.75 
 
 
80 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  61.84 
 
 
130 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  60.98 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  60.98 
 
 
96 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  62.96 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.44 
 
 
84 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.5 
 
 
91 aa  103  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.9 
 
 
77 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 
80 aa  99.4  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  61.04 
 
 
82 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  57.47 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  58.9 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  59.21 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  60.53 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  60.53 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.33 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  58.44 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  63.77 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  63.77 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  60.56 
 
 
86 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.58 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  48.78 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  49.33 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  57.75 
 
 
89 aa  90.1  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  53.01 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  52.63 
 
 
338 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  56.34 
 
 
88 aa  88.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48 
 
 
103 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48 
 
 
103 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  58.9 
 
 
79 aa  87  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  56.58 
 
 
83 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  57.33 
 
 
87 aa  85.9  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.25 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  52.33 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.1 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.12 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.59 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.58 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  45 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.78 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  48.05 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  42.35 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  43.82 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  42.67 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 
88 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  43.59 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  43.18 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  49.3 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  43.18 
 
 
237 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  46.48 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  41.56 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  47.3 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  45 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.46 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  42.5 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  42.5 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.56 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.56 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.56 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  45.33 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  41.03 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 
295 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 
299 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.51 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.93 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.53 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.96 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  42.68 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  43.68 
 
 
322 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  43.68 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>