More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3436 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  73.19 
 
 
318 aa  331  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  67.23 
 
 
330 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  65.53 
 
 
324 aa  298  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  62.29 
 
 
320 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  61.68 
 
 
335 aa  284  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
328 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  48.87 
 
 
324 aa  275  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  52.31 
 
 
265 aa  275  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  62 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  57.26 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  58.8 
 
 
323 aa  268  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  53.55 
 
 
336 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  51.79 
 
 
334 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  52.68 
 
 
337 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  52.68 
 
 
337 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
334 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  52.68 
 
 
337 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  52.34 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  53.41 
 
 
285 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  53.7 
 
 
336 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  56.56 
 
 
331 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  57.58 
 
 
341 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  54.71 
 
 
324 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  49.77 
 
 
342 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
318 aa  244  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  56.6 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  57.08 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  62.38 
 
 
326 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
330 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  51.4 
 
 
329 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  50.47 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  50.47 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 
334 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  45.86 
 
 
332 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  41.11 
 
 
328 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  56.93 
 
 
342 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  46.07 
 
 
334 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  51.4 
 
 
328 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  46.07 
 
 
334 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  50.93 
 
 
326 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  50.22 
 
 
326 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  54.84 
 
 
333 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
322 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  51.17 
 
 
324 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  50.7 
 
 
330 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
331 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  50.47 
 
 
336 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  47.66 
 
 
329 aa  227  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  48.77 
 
 
324 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  52.56 
 
 
337 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
333 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  47.7 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  49.55 
 
 
324 aa  217  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  51.8 
 
 
328 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  49.53 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 
338 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  44.79 
 
 
324 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  45.68 
 
 
325 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  52.13 
 
 
326 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  38.82 
 
 
329 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  45.15 
 
 
329 aa  208  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  43.06 
 
 
331 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  43.5 
 
 
332 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  43.5 
 
 
332 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  52.31 
 
 
332 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  41.63 
 
 
331 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  40.67 
 
 
331 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  46.15 
 
 
262 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
314 aa  188  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  37.77 
 
 
314 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  43.54 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
329 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.05 
 
 
411 aa  162  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.47 
 
 
317 aa  159  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
255 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 
316 aa  155  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.11 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  39.44 
 
 
360 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
541 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.32 
 
 
247 aa  152  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  34.47 
 
 
250 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>