18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0023 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  100 
 
 		 385 aa  792    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  42.27 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  41.41 
 
 		 476 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  38.52 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  26.94 
 
 		 1204 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  28.9 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  31.95 
 
 		 631 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.08 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  31.15 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  22.87 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.19 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  29.74 
 
 		 741 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  28.17 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  28.04 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  29.09 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.11 
 
 		 720 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  32.94 
 
 		 1621 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>