More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4802 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 373 aa  766    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  43.85 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8495  glycosyl transferase family 2  48.34 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  41.92 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 		 338 aa  199  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  31.37 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.27 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.82 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 235 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 277 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.01 
 
 		 312 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 727 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 1035 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 597 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  30.73 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  25.82 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  41.09 
 
 		 700 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 316 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 334 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 276 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  45.19 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.28 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 		 703 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 1067 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  31.03 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 1252 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 1252 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  29.18 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.49 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  42.42 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1177 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1177 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 930 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 1037 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0591  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  30 
 
 		 181 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>