127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  57.97 
 
 
848 aa  963    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  62.48 
 
 
858 aa  992    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  61.2 
 
 
843 aa  990    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  100 
 
 
825 aa  1686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  45.99 
 
 
790 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  48.02 
 
 
795 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  49.33 
 
 
795 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  47.44 
 
 
795 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  44.63 
 
 
790 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  45.62 
 
 
767 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  46.85 
 
 
781 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  70.31 
 
 
834 aa  1154    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  46.22 
 
 
786 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  44.5 
 
 
807 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  38.67 
 
 
780 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  40.43 
 
 
804 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  42.24 
 
 
784 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  37.37 
 
 
781 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.25 
 
 
786 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  40.31 
 
 
800 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  42.8 
 
 
791 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 
787 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  40.12 
 
 
787 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  40.12 
 
 
787 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  40.61 
 
 
791 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  40.88 
 
 
810 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  41.36 
 
 
784 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.18 
 
 
786 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  36.28 
 
 
778 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  43.2 
 
 
824 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  40.5 
 
 
794 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.84 
 
 
787 aa  545  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  40.95 
 
 
789 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  40.03 
 
 
786 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  40.18 
 
 
790 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  36.03 
 
 
780 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  38.96 
 
 
780 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  38.13 
 
 
777 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  34.48 
 
 
788 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  37.1 
 
 
778 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  33.29 
 
 
789 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  38.06 
 
 
782 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  30.46 
 
 
780 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  34.18 
 
 
986 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  30.43 
 
 
775 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.74 
 
 
749 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  26.55 
 
 
805 aa  336  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  29.86 
 
 
750 aa  333  9e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 
755 aa  331  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.61 
 
 
759 aa  331  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  30.24 
 
 
758 aa  328  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.76 
 
 
720 aa  324  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.52 
 
 
789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 
757 aa  321  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.32 
 
 
748 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.83 
 
 
965 aa  320  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  28.68 
 
 
787 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
978 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  30.38 
 
 
751 aa  314  3.9999999999999997e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  29.37 
 
 
755 aa  312  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  29.37 
 
 
755 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  29.49 
 
 
755 aa  312  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  29.37 
 
 
755 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  29.37 
 
 
755 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  29.11 
 
 
755 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.8 
 
 
787 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  29.11 
 
 
755 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  29.37 
 
 
755 aa  307  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.28 
 
 
774 aa  306  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  30.23 
 
 
752 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.96 
 
 
763 aa  306  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.74 
 
 
765 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.98 
 
 
781 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
759 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.4 
 
 
794 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.65 
 
 
771 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  28.59 
 
 
807 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28.64 
 
 
761 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  32.04 
 
 
760 aa  300  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.7 
 
 
761 aa  297  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  26.34 
 
 
769 aa  297  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  25.88 
 
 
768 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28 
 
 
778 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  25.74 
 
 
767 aa  291  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.63 
 
 
762 aa  290  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.23 
 
 
710 aa  288  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.37 
 
 
777 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.28 
 
 
752 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.67 
 
 
1051 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.19 
 
 
776 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.91 
 
 
1050 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.26 
 
 
1051 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.33 
 
 
1052 aa  240  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.46 
 
 
1053 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  26.65 
 
 
753 aa  237  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  27.9 
 
 
704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  27 
 
 
807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.78 
 
 
794 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.43 
 
 
807 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.03 
 
 
1053 aa  231  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>