More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3849 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  86.27 
 
 		 415 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.13 
 
 		 415 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.13 
 
 		 415 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.37 
 
 		 415 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  852    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  98.31 
 
 		 415 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  98.07 
 
 		 415 aa  835    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.13 
 
 		 415 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 		 415 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.49 
 
 		 420 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 		 415 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.57 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.01 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.27 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.7 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.24 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.27 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.15 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 		 420 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.77 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.87 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.27 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.61 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.21 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 		 415 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.42 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.92 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.43 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.63 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.41 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.35 
 
 		 418 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.65 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.71 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.52 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 		 414 aa  362  9e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.46 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.94 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.78 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.25 
 
 		 426 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.84 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.03 
 
 		 419 aa  358  9e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 		 420 aa  358  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.36 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.37 
 
 		 423 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.96 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.06 
 
 		 415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.71 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 423 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.71 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.57 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.26 
 
 		 436 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.55 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.02 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.11 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.61 
 
 		 418 aa  354  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.62 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.36 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.54 
 
 		 424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 		 427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0227  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.81 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.287759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.92 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>