57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3693 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  85.98 
 
 
214 aa  352  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  77.84 
 
 
212 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  75.26 
 
 
212 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  54.68 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  57.14 
 
 
185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  57.25 
 
 
185 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  59.17 
 
 
181 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  46.03 
 
 
186 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  58.21 
 
 
187 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  55.4 
 
 
185 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  57.14 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  54.93 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  54.68 
 
 
185 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  54.68 
 
 
185 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  54.23 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  54.23 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  54.23 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  55.47 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  55.47 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  55.47 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  55.47 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  36.16 
 
 
179 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  36.16 
 
 
182 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  37.64 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  37.36 
 
 
179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  35.59 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  41.78 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  33.9 
 
 
182 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  40.46 
 
 
182 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  38.62 
 
 
179 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  35.96 
 
 
179 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  39.25 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  34.94 
 
 
139 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  27.96 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  26.19 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  31.18 
 
 
137 aa  51.6  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  28.71 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  27.78 
 
 
173 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  32.65 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  23.81 
 
 
131 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  23.48 
 
 
149 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  30.7 
 
 
142 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  33.72 
 
 
85 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.84 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 
138 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  24.41 
 
 
144 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.5 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  28.4 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.77 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  26.56 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.75 
 
 
284 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 
174 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>