More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3514 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  95.26 
 
 
570 aa  1103    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  96.88 
 
 
545 aa  1070    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  59.49 
 
 
579 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  80.54 
 
 
563 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  70.33 
 
 
573 aa  777    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  93.86 
 
 
570 aa  1086    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  68.73 
 
 
590 aa  743    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  65.31 
 
 
565 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  99.3 
 
 
570 aa  1161    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  99.47 
 
 
570 aa  1163    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  95.26 
 
 
570 aa  1103    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  95.26 
 
 
570 aa  1103    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  95.26 
 
 
570 aa  1103    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
570 aa  1168    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  83.19 
 
 
568 aa  951    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  80.78 
 
 
564 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  71.72 
 
 
563 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  58.9 
 
 
593 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  49.47 
 
 
565 aa  534  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  48.65 
 
 
601 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  45.91 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  44.85 
 
 
534 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  44.98 
 
 
534 aa  415  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  43.38 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  47.45 
 
 
542 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  46.53 
 
 
542 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  43.43 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  45.07 
 
 
533 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  43.44 
 
 
536 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  44.65 
 
 
537 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  42.04 
 
 
537 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  43.8 
 
 
530 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  43.01 
 
 
539 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.25 
 
 
538 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 
568 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  43.43 
 
 
541 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  42.67 
 
 
529 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  41.36 
 
 
534 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.44 
 
 
538 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  42.65 
 
 
535 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  43.17 
 
 
545 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  43.62 
 
 
533 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  42.81 
 
 
545 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 
526 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  43.02 
 
 
541 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  40.82 
 
 
525 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  41.01 
 
 
534 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  41.88 
 
 
539 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  43.09 
 
 
529 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  42.25 
 
 
538 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  42.52 
 
 
538 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 
542 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  43.44 
 
 
549 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 
531 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  42.48 
 
 
539 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  42.28 
 
 
552 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  43.31 
 
 
542 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
529 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  42.94 
 
 
538 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.38 
 
 
553 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
525 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
545 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 
531 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  40.55 
 
 
539 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  43.07 
 
 
552 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  41.03 
 
 
543 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  40.75 
 
 
531 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  43.07 
 
 
532 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  41.23 
 
 
634 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  43.18 
 
 
592 aa  356  6.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  39.62 
 
 
541 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  41.2 
 
 
557 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  41.2 
 
 
557 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  41.2 
 
 
557 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  41.02 
 
 
557 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  41.02 
 
 
557 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  41.02 
 
 
557 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  41.02 
 
 
557 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  40.78 
 
 
522 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  42.54 
 
 
541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.32 
 
 
540 aa  350  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  38.99 
 
 
525 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  41.88 
 
 
531 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  38.05 
 
 
533 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  37.69 
 
 
606 aa  346  8.999999999999999e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  39.64 
 
 
542 aa  343  5e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  39.14 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  40.76 
 
 
546 aa  343  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
525 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 
558 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  42.16 
 
 
539 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  42.12 
 
 
562 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 
589 aa  340  4e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 
546 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 
542 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  40.4 
 
 
546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  40.4 
 
 
546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.89 
 
 
527 aa  337  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 
546 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>