281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3368 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
176 aa  357  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  52.69 
 
 
169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.09 
 
 
187 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  59.04 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  55.17 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.6 
 
 
170 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.6 
 
 
170 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.6 
 
 
170 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.02 
 
 
170 aa  157  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  55.17 
 
 
170 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.02 
 
 
170 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.6 
 
 
170 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.91 
 
 
199 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.74 
 
 
170 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  57.05 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.7 
 
 
169 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.81 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  44.94 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  44.94 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  40 
 
 
171 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  46.75 
 
 
178 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.36 
 
 
171 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  43.15 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.04 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.32 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.25 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.34 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.97 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.57 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.72 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.56 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.3 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.3 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.14 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.66 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.95 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.12 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.12 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  38.04 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.98 
 
 
200 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.95 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  36.96 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.85 
 
 
200 aa  62  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.95 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.6 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34 
 
 
272 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.21 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  33.08 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.19 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.98 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  38.58 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.19 
 
 
279 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.85 
 
 
209 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.83 
 
 
273 aa  57.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.78 
 
 
378 aa  57.8  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.22 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.84 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.13 
 
 
438 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.78 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.7 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  44.05 
 
 
439 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.86 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
249 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.73 
 
 
225 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.94 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.62 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.96 
 
 
227 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0468  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.9 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.89 
 
 
208 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.39 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  28.25 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.75 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.22 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.9 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.47 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  24.02 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  43.37 
 
 
438 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  29.01 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.37 
 
 
438 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  29.01 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.11 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  29.01 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.37 
 
 
438 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.66 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  32.39 
 
 
266 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.37 
 
 
438 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  27.12 
 
 
199 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.47 
 
 
187 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.11 
 
 
179 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0422  phosphoesterase PA-phosphatase related  37 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  28.4 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.52 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  28.4 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.51 
 
 
225 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.78 
 
 
438 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.41 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.84 
 
 
199 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  42.5 
 
 
437 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.14 
 
 
510 aa  51.2  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>