43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2903 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  68.06 
 
 		 290 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  64.08 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.08 
 
 		 290 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  63.46 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  64.08 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  63.75 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  63.43 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  63.43 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  63.75 
 
 		 290 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  63.75 
 
 		 290 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  64.72 
 
 		 291 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  62.46 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  62.46 
 
 		 290 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  59.42 
 
 		 291 aa  328  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  53.7 
 
 		 291 aa  314  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  51.95 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  49.03 
 
 		 291 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  50.97 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  38.59 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  38.44 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  34.2 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.44 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  30.03 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  31.05 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  32.46 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.31 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  31.46 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  30.63 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  33.23 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  32.19 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  32.59 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  27.13 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  30.67 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  26.32 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.03 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  28.33 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>