More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2595 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2595  heat shock protein HtpX  100 
 
 
287 aa  580  1e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.2859e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2672  heat shock protein HtpX  99.65 
 
 
287 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.4307e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1787  heat shock protein HtpX  99.65 
 
 
287 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.09217e-09  unclonable  2.94805e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2557  heat shock protein HtpX  99.65 
 
 
287 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.24131e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2351  heat shock protein HtpX  96.49 
 
 
287 aa  561  1e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.33306e-08  decreased coverage  5.58904e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2423  heat shock protein HtpX  96.49 
 
 
287 aa  561  1e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.96306e-06  decreased coverage  0.000159702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2728  heat shock protein HtpX  95.8 
 
 
287 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2512  heat shock protein HtpX  96.14 
 
 
287 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  8.04246e-07  hitchhiker  1.51109e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2334  heat shock protein HtpX  95.8 
 
 
287 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2770  heat shock protein HtpX  93.38 
 
 
287 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.6103e-08  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1568  heat shock protein HtpX  92.33 
 
 
287 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1805  heat shock protein HtpX  91.96 
 
 
287 aa  540  1e-152  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00990556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2130  heat shock protein HtpX  90.94 
 
 
287 aa  534  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.29108e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1870  heat shock protein HtpX  91.23 
 
 
286 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.98337e-08  decreased coverage  2.73108e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1723  heat shock protein HtpX  89.9 
 
 
287 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.57651e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1443  heat shock protein HtpX  84.32 
 
 
296 aa  504  1e-142  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  8.16219e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2748  heat shock protein HtpX  62.11 
 
 
288 aa  355  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.459812  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00404  heat shock protein HtpX  59.38 
 
 
292 aa  345  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1883  heat shock protein HtpX  57.79 
 
 
293 aa  339  3e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000193864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  59.8 
 
 
295 aa  338  6e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  57.59 
 
 
294 aa  337  1e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01813  heat shock protein HtpX  60.69 
 
 
289 aa  337  1e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2175  heat shock protein HtpX  57.44 
 
 
293 aa  336  2e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  5.24966e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0635  heat shock protein HtpX  61.94 
 
 
287 aa  336  3e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.79457e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  335  4e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1322  heat shock protein HtpX  59.66 
 
 
291 aa  335  4e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003866  hypothetical protein  61.38 
 
 
289 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  8.8454e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  58.48 
 
 
293 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1916  heat shock protein HtpX  60.21 
 
 
288 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2120  heat shock protein HtpX  57.64 
 
 
292 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.01821e-09  hitchhiker  9.53283e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2058  HtpX domain protein  56.75 
 
 
294 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.52797e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  58.42 
 
 
293 aa  328  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.79868e-05  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  58.42 
 
 
293 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  58.42 
 
 
293 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.29476e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.83907e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.80088e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.37122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  1e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  56.94 
 
 
293 aa  326  2e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1034  heat shock protein HtpX  57.29 
 
 
293 aa  327  2e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  56.94 
 
 
293 aa  326  2e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  56.94 
 
 
293 aa  325  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2189  heat shock protein HtpX  57.49 
 
 
289 aa  324  9e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.436394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3166  HtpX peptidase  54.21 
 
 
300 aa  324  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.51395e-05  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1051  HtpX domain protein  56.23 
 
 
309 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2100  heat shock protein HtpX  57.14 
 
 
289 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3464  heat shock protein HtpX  59.18 
 
 
292 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  54.67 
 
 
283 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  58.02 
 
 
291 aa  314  1e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1626  heat shock protein HtpX  55.44 
 
 
298 aa  313  2e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.67884e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3307  heat shock protein HtpX  57.14 
 
 
292 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650708  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0930  heat shock protein HtpX  53.87 
 
 
287 aa  309  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.173766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  57.38 
 
 
295 aa  308  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2524  heat shock protein HtpX  55.82 
 
 
290 aa  308  6e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0533097  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27480  heat shock protein HtpX  56.12 
 
 
291 aa  307  1e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.538581  normal  0.110611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0715  HtpX domain-containing protein  54.7 
 
 
301 aa  308  1e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.931885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2325  heat shock protein HtpX  56.12 
 
 
291 aa  307  1e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  55.29 
 
 
292 aa  303  1e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3984  heat shock protein HtpX  53.54 
 
 
295 aa  302  4e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2603  heat shock protein HtpX  56.12 
 
 
291 aa  301  6e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.678894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  53.18 
 
 
300 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1480  heat shock protein HtpX  53.2 
 
 
295 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1446  heat shock protein HtpX  53.2 
 
 
295 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.501086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3844  heat shock protein HtpX  53.2 
 
 
295 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00537908  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  54.17 
 
 
289 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1981  peptidase M48, Ste24p  53.72 
 
 
297 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1871  heat shock protein HtpX  53.2 
 
 
295 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1774  HtpX domain-containing protein  55.48 
 
 
293 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0377  heat shock protein HtpX  54.85 
 
 
295 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  52.56 
 
 
294 aa  295  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0293  heat shock protein HtpX  55.48 
 
 
292 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.985067 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0307  heat shock protein HtpX  51.75 
 
 
291 aa  290  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.173543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3616  heat shock protein HtpX  51.18 
 
 
295 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1778  heat shock protein HtpX  51.18 
 
 
295 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.463341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1580  heat shock protein HtpX  54.08 
 
 
291 aa  283  2e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.35294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0373  heat shock protein HtpX  49.83 
 
 
290 aa  283  2e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0986  heat shock protein HtpX  54.08 
 
 
291 aa  282  5e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.419711  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3742  heat shock protein HtpX  53.06 
 
 
292 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1962  heat shock protein HtpX  53.74 
 
 
291 aa  278  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.409583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1447  heat shock protein HtpX  53.74 
 
 
291 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.21092e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3142  heat shock protein HtpX  50.68 
 
 
300 aa  274  1e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.8089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3023  heat shock protein HtpX  52.72 
 
 
292 aa  274  1e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4316  heat shock protein HtpX  52.4 
 
 
291 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.118481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2395  heat shock protein HtpX  53.06 
 
 
303 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3463  heat shock protein HtpX  52.05 
 
 
291 aa  269  3e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  50 
 
 
303 aa  268  9e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3448  heat shock protein HtpX  51.03 
 
 
291 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1059  heat shock protein HtpX  51.7 
 
 
291 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.548396  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1388  heat shock protein HtpX  52.4 
 
 
321 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4018  heat shock protein HtpX  52.54 
 
 
291 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75488e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1214  heat shock protein HtpX  52.74 
 
 
292 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1032  heat shock protein HtpX  49.32 
 
 
291 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0859  heat shock protein HtpX  48.63 
 
 
290 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0528  heat shock protein HtpX  49 
 
 
294 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.2228e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>