22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0347 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0347  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0393217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0354  TPR repeat-containing protein  98.72 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0784365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0349  TPR repeat-containing protein  97.44 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0357  TPR domain-containing protein  97.01 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000167049  decreased coverage  0.00000000909482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0324  TPR repeat-containing protein  76.82 
 
 		 234 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3619  TPR repeat-containing protein  77.68 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0353  TPR domain-containing protein  81.04 
 
 		 232 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3816  TPR repeat-containing protein  76.82 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4589  TPR repeat-containing protein  61.57 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0359  TPR repeat-containing protein  58.05 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3473  TPR repeat-containing protein  62.19 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3504  TPR repeat-containing protein  56.52 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  35.56 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6282  hypothetical protein  35.92 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0309056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1235  hypothetical protein  36.78 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0213  hypothetical protein  26.49 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.67 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.67 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2147  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0794715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.95 
 
 		 308 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.446207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.45 
 
 		 306 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 361 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>