56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  65.44 
 
 
140 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  60.58 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  51.82 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  45.74 
 
 
143 aa  121  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.08 
 
 
143 aa  116  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  44.27 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  43.09 
 
 
138 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  42.28 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  48 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  45.67 
 
 
141 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  46.43 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  31.71 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  31.71 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  29.55 
 
 
500 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  29.55 
 
 
616 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  30.66 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  30.6 
 
 
615 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  35.87 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  38.18 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
576 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  29.91 
 
 
593 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  31.87 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  29.91 
 
 
600 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  29.91 
 
 
600 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  29.51 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
571 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
571 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  33.7 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  34.04 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  28.21 
 
 
600 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  32.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.55 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  31.18 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  29.79 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  31.01 
 
 
588 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  26.27 
 
 
613 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.56 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.2 
 
 
494 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  32.97 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  25.17 
 
 
597 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.36 
 
 
160 aa  40.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  33.72 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  31.18 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  28.57 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  25.9 
 
 
598 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.31 
 
 
585 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>