44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0964 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 134 aa  273  8e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  49.64 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  53.54 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  48.87 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  48.36 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  40.58 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  47.9 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  41.55 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  41.55 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.57 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  37.86 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  41.55 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  33.33 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  33.33 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 396 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  42.71 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  35.25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0900  flavodoxin  35.94 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  28.77 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.25 
 
 		 423 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  28.77 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  29.1 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  29.17 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  28.08 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  30.07 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  37.1 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 395 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  28.67 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  29.14 
 
 		 404 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  40.35 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.77 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  35.16 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  33.77 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  25.35 
 
 		 613 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  31.58 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.84 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 615 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  33.68 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>