292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1143 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  65.54 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  62.84 
 
 		 148 aa  183  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  43.92 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  36.03 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  35.56 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  32.82 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  34.81 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  34.81 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  34.81 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  33.56 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  30.53 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  33.86 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  31.67 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  29.14 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  30.71 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  30.71 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.67 
 
 		 613 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  30.28 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  34.59 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  34.35 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  30.71 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  32.95 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.97 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  32.64 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  29.25 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  34.96 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  30.07 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 		 1407 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  34.96 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  34.96 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  29.8 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 730 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.8 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  29.08 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  31.29 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  37.1 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  29.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  29.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  31.01 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  30.56 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  34.15 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  31.01 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 		 735 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  31.01 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  29.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  24.49 
 
 		 626 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  30.82 
 
 		 608 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  30.71 
 
 		 631 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.03 
 
 		 610 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  24.49 
 
 		 629 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.5 
 
 		 623 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  32.28 
 
 		 628 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  34.65 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.14 
 
 		 612 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  36.15 
 
 		 615 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  29.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  28.37 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.08 
 
 		 607 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  31.15 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  37.07 
 
 		 1396 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.31 
 
 		 600 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  29.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  29.53 
 
 		 599 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  32.52 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  32.52 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  30.61 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  29.53 
 
 		 599 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.53 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  34.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  34.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  32.52 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>