More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0539 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  100 
 
 
147 aa  285  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  83.56 
 
 
147 aa  239  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  72.11 
 
 
147 aa  193  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  56.95 
 
 
152 aa  161  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1727  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.48 
 
 
149 aa  141  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1393  flavodoxin  47.86 
 
 
150 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000245556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  45.52 
 
 
148 aa  124  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  44.22 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  44.22 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  44.22 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  44.22 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  37.76 
 
 
161 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  43.54 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  43.54 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  44.37 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  43.54 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  42.86 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  42.18 
 
 
147 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  37.86 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  37.16 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  36.49 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  35.81 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  37.68 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.84 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  32.84 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  37.8 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  31.5 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  32.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  32.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  30.71 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  30.71 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  35.48 
 
 
628 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  30.71 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  34.65 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  29.92 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  36.61 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 
1341 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  32.65 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  29.92 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  29.92 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  29.92 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  33.86 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  31.01 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 
1357 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  24.83 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  27.78 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.58 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.43 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  28.67 
 
 
613 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  30.71 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.11 
 
 
584 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  25.49 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  30.7 
 
 
602 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.88 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  33.33 
 
 
1427 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  23.65 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 
1338 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
1397 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 
1400 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.87 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.11 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 
1317 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
1395 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.95 
 
 
1395 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.15 
 
 
1401 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
1395 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  30.77 
 
 
623 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
1395 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  25.68 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  32.87 
 
 
538 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.41 
 
 
1271 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.5 
 
 
1383 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
595 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.95 
 
 
614 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.59 
 
 
610 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  29.87 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  32.54 
 
 
1398 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  31.94 
 
 
1312 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.54 
 
 
1418 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.1 
 
 
600 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.78 
 
 
599 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  29.85 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.78 
 
 
599 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  28.76 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>