82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1393 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1393  flavodoxin  100 
 
 
150 aa  297  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000245556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  57.72 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1727  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.05 
 
 
149 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  47.55 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  47.86 
 
 
147 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  45.71 
 
 
147 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  39.73 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  36.69 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  35.97 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  35.97 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  35.97 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  35.25 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  35.25 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  35.25 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  35.25 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  35.25 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  35.25 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  32.87 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  30.07 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  28.67 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  28.89 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.03 
 
 
628 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2284  flavodoxin/nitric oxide synthase  31 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  28.7 
 
 
602 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  29.01 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 
1317 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  30.23 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 
1312 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  27.64 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  28.24 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.48 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.08 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  27.48 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  27.48 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.24 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  30.28 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 
1397 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  27.48 
 
 
147 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  26.83 
 
 
147 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  27.48 
 
 
147 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  27.48 
 
 
147 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  27.48 
 
 
147 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  28.24 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  29.7 
 
 
1395 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  29.7 
 
 
1395 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  26.83 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  26.83 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  29.7 
 
 
1395 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.79 
 
 
1271 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.79 
 
 
1271 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.79 
 
 
1271 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  26.02 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 
1397 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
1405 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10283  oxidoreductase, hypothetical protein (Eurofung)  31.48 
 
 
654 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.384937  normal  0.391793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.78 
 
 
607 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  26.71 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  28.7 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  28.57 
 
 
154 aa  42  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  26.15 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 
1396 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  23.2 
 
 
584 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  26.87 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.93 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  23.48 
 
 
610 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  30 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  32.69 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  24.31 
 
 
1394 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.25 
 
 
629 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  29.46 
 
 
178 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.22 
 
 
593 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 
1384 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  23.01 
 
 
607 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>