More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0628 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  100 
 
 		 147 aa  291  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  72.11 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  74.13 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  52.32 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1393  flavodoxin  45.71 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000245556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1727  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.55 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  46.83 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  46.83 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  46.83 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  46.83 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  46.83 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  46.03 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  43.45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  46.03 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  46.03 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  46.03 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  45.24 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  37.06 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  40.94 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  37.06 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  35.66 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  36.96 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  37.4 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  36.92 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.17 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  32.17 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  31.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  31.47 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  30.07 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  29.37 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  32.26 
 
 		 628 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  29.37 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  29.37 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  29.37 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.51 
 
 		 584 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.17 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  30.07 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  30.07 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  30.07 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.77 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  26.35 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  31.51 
 
 		 602 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.82 
 
 		 1405 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  30.77 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.1 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  35.9 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  30.61 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  27.94 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 589 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35 
 
 		 1383 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.03 
 
 		 613 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  27.7 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  38.71 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 538 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.71 
 
 		 1401 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  27.81 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  34.23 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.71 
 
 		 595 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.71 
 
 		 595 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 593 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  28.67 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  28.78 
 
 		 1403 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  33.8 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  31.1 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 1338 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 1400 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  27.97 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  29.71 
 
 		 1427 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 1395 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  29.37 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  30.61 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 1395 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 		 1407 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  29.71 
 
 		 1398 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 1395 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 1397 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 		 1418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.66 
 
 		 607 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.23 
 
 		 629 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  31.08 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  28.38 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>