More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0576 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  65.54 
 
 		 148 aa  197  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  60.81 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  48.61 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  38.93 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  41.18 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  41.18 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  41.67 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  35.88 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  35.88 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  40.44 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  39.71 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  34.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  35 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  37.4 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  34.65 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  34.65 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  42.74 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  36.89 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  40.14 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  32.17 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  43.22 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  40.98 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  40.98 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  36.89 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  42.74 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  40.83 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  40.98 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  39.84 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  41.88 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  37.06 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  35.62 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  41.13 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  38.71 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  37.61 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.56 
 
 		 735 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  35.62 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  38.19 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  32.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  35.11 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  35.62 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  34 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.3 
 
 		 730 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  37.9 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  34.35 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  34.35 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  32.31 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  34.93 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  32.28 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  29.55 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  36.09 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.39 
 
 		 1401 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.3 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  30.3 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  32.84 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  36.89 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  31.06 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  31.06 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  35.83 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  33.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  32.54 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  35.25 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.82 
 
 		 1403 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  35.9 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  31.06 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  29.85 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  31.06 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  35.25 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  34.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  31.58 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>