277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3168 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  76.32 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  68.46 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  59.74 
 
 		 154 aa  199  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  62.34 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  59.74 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  59.74 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  59.74 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  61.69 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  58.44 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  59.74 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  58.44 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  58.78 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  57.79 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  58.39 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  56.08 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  44.37 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  45.27 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  45.27 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  43.71 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  45.27 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  44.59 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  41.61 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  46.62 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  46.62 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  40.54 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  46.62 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  41.89 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.27 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  43.54 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.19 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.14 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  37.16 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  37.16 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  37.16 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  41.06 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  35.62 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  36.73 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  41.96 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  36.99 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  35.81 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  36.49 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  42.36 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  41.67 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  41.67 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  41.26 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  38.78 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  36.55 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  33.78 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  39.46 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  35.62 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.84 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.11 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  35.25 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  39.44 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.72 
 
 		 614 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  33.11 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.11 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.11 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  34.53 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  34.72 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  32.43 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  33.77 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  39.2 
 
 		 631 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.97 
 
 		 613 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  40 
 
 		 623 aa  91.3  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  33.11 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  33.56 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.84 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  32.88 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.66 
 
 		 613 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  33.11 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  30.41 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.24 
 
 		 629 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.24 
 
 		 626 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  32.43 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  32.43 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  30.41 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  33.56 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1908  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.55 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  32.03 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>