More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1148 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  100 
 
 		 147 aa  287  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  83.56 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  74.13 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1386  flavodoxin  54.05 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1727  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.35 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1393  flavodoxin  47.55 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000245556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  45.83 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  45.71 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  45.71 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  45.71 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  45.71 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  45 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  45.93 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  45 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  45 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  44.29 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  43.84 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  39.16 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  40.71 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  36.49 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  35.81 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  35.14 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  36.23 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  39.37 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  34.11 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  33.56 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.19 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  34.65 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.28 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  32.28 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  31.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  31.5 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.05 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  32.31 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  30.71 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  29.92 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  36.84 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  29.92 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  29.13 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  32.26 
 
 		 628 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  33.12 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  27.59 
 
 		 613 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.43 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  28.38 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  28.38 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.69 
 
 		 607 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  27.7 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.53 
 
 		 626 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.53 
 
 		 629 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.92 
 
 		 602 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.85 
 
 		 584 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  28.91 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.64 
 
 		 1271 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  29.13 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  25 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  25.71 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  29.13 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  29.13 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  34.35 
 
 		 1405 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  27.03 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.64 
 
 		 1271 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  28.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.64 
 
 		 1271 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.25 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.56 
 
 		 610 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  25 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  25.52 
 
 		 631 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  22.97 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 		 1394 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  28.91 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.15 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  26.19 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.78 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 1317 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  25.78 
 
 		 614 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  28.35 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.28 
 
 		 1395 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 1395 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.87 
 
 		 1401 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 1395 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.77 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 1395 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  30.72 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 		 1407 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.06 
 
 		 607 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  26.98 
 
 		 623 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  25.68 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  27.82 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>