236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5048 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.77 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.4 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  39.62 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.79 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  36.2 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.81 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  34.97 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  39.22 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  37.82 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  38.04 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  39.26 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  38.22 
 
 		 146 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  37.89 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  36.54 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  35.98 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  36.2 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  35.58 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  36.02 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  34.36 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  36.2 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  37.27 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  36.02 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  34.97 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  34.97 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  35.67 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  34.97 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  36.94 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  35.67 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  36.94 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.81 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  35.58 
 
 		 147 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  35.58 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  35.58 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  34.36 
 
 		 146 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  35.58 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  38.55 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  38.55 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  38.55 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  38.55 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  38.55 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  38.55 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  37.95 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  37.95 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.95 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  34.97 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  33.74 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  33.55 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  29.94 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  30.13 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  28.21 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  28.21 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  28.21 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  28.21 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  28.48 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  28.22 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  27.85 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  27.85 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  29.11 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  28.66 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  28.03 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.01 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  28.21 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  31.21 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  27.11 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.19 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  28.05 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.57 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  27.44 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  27.44 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  30.13 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  27.44 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.82 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  27.44 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  31.71 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  27.44 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  28.22 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  27.61 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.83 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  26.83 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  33.12 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  31.29 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  26.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  27.61 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  27.61 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  25 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1908  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.22 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  28.83 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  28.83 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  29.75 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  26.99 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  28.83 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  27.67 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  29.75 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  28.85 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>