137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10970 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  100 
 
 
140 aa  280  6.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  73.57 
 
 
140 aa  222  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  68.85 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  55 
 
 
143 aa  153  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  50.36 
 
 
143 aa  150  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  45.14 
 
 
145 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.8 
 
 
143 aa  128  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  43.48 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  42.75 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.54 
 
 
134 aa  124  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  43.17 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  44.29 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  32.14 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  32.14 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  34.75 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  36.8 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  33.1 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  33.1 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  33.33 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  32.62 
 
 
148 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  32.62 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  30.22 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  31.03 
 
 
500 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  33.06 
 
 
615 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  32.5 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  31.03 
 
 
616 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  31.91 
 
 
598 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.13 
 
 
423 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.87 
 
 
504 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
576 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  32.09 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.86 
 
 
500 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.6 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  31.03 
 
 
613 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.65 
 
 
201 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  29.25 
 
 
396 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.08 
 
 
573 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  33.04 
 
 
597 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  36.99 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  29.71 
 
 
597 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
264 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  27.59 
 
 
600 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.64 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  27.46 
 
 
403 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  27.59 
 
 
600 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  26.06 
 
 
600 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
400 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  27.59 
 
 
593 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
571 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
571 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.14 
 
 
494 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  28.1 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.14 
 
 
498 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.17 
 
 
493 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26.43 
 
 
479 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  40 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.26 
 
 
573 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  28.83 
 
 
584 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.57 
 
 
202 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  29.93 
 
 
588 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
482 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.26 
 
 
573 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
485 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  29.25 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  28.26 
 
 
570 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.71 
 
 
479 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.19 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.84 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  29.37 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  27.97 
 
 
404 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>