More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  55.97 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  54.43 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  37.42 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  35.33 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  41.73 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  35.53 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  34.19 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  37.41 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  36.44 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34.53 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.28 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  44.86 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.11 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  34.27 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  35.25 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  34.29 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  35.53 
 
 		 207 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  34.64 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  35.88 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  37.4 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  35.96 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.33 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  35.11 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  31.94 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  39.09 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  32.68 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  39.17 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  36.73 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  39.17 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  34 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  34.56 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  39.17 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  36.62 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  39.22 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.03 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  34.97 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  38.74 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  32.65 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  30.72 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  28.67 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  37.67 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  34.44 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  29.5 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  33.58 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  31.37 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  29.49 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  32.09 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>