More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1756 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
384 aa  783    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  53.33 
 
 
365 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.5 
 
 
377 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  51.27 
 
 
376 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
374 aa  361  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.42 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  52.32 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
375 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  51.62 
 
 
377 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  50.67 
 
 
376 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
379 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
379 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  50.67 
 
 
376 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
380 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
379 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
379 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
379 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  49.3 
 
 
379 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  49.3 
 
 
379 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  50.68 
 
 
397 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  49.3 
 
 
379 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
376 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  50.41 
 
 
374 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  50.41 
 
 
374 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
373 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  48.53 
 
 
378 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
374 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  51.89 
 
 
377 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
377 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
389 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  53.54 
 
 
375 aa  348  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  49.86 
 
 
377 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
374 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  48.77 
 
 
378 aa  345  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  48.5 
 
 
378 aa  345  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
375 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  46.85 
 
 
375 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  51.44 
 
 
379 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  49.72 
 
 
374 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  47.85 
 
 
385 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  46.05 
 
 
375 aa  342  9e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  48.92 
 
 
382 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  49.15 
 
 
381 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  47.21 
 
 
380 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  46.07 
 
 
377 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  49.58 
 
 
382 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  50.43 
 
 
378 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  51.34 
 
 
380 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  48.12 
 
 
375 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  49.87 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  51.35 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  49.47 
 
 
378 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
376 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
378 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  46.58 
 
 
382 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
378 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
378 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  49.19 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  45.33 
 
 
380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
378 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
378 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  49.59 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
377 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  48.13 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  48.73 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  50.14 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  50 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  47.28 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  46.3 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  51.41 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  51.08 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  49.06 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  46.59 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  46.2 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  49.57 
 
 
377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  47.28 
 
 
374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  45.95 
 
 
378 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  48.79 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
376 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
376 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
376 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
376 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  48.36 
 
 
376 aa  335  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  50.84 
 
 
377 aa  335  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>