More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3562 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  100 
 
 
242 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  97.93 
 
 
242 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  98.35 
 
 
242 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  89.26 
 
 
242 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.21412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  89.67 
 
 
242 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  68.6 
 
 
411 aa  355  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  68.6 
 
 
411 aa  355  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  68.6 
 
 
411 aa  355  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  68.6 
 
 
411 aa  355  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  68.6 
 
 
411 aa  355  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.08961e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  68.07 
 
 
250 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  64.32 
 
 
255 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  63.9 
 
 
409 aa  339  3e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  63.9 
 
 
255 aa  338  6e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  63.49 
 
 
255 aa  337  1e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  63.49 
 
 
255 aa  337  1e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  63.49 
 
 
255 aa  337  1e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  63.9 
 
 
255 aa  337  1e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  63.9 
 
 
255 aa  336  2e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  63.9 
 
 
255 aa  336  2e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  63.9 
 
 
267 aa  335  4e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.15252e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.2055e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.74651e-05  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.20784e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  331  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
267 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  331  7e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25795e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  331  7e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  331  7e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.64149e-07  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  331  7e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  330  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  7.22293e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  330  9e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  64.38 
 
 
266 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 
267 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
267 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 
267 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  64.78 
 
 
269 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  63.95 
 
 
268 aa  313  1e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  65.64 
 
 
234 aa  310  9e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  58.8 
 
 
278 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  58.8 
 
 
278 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  58.8 
 
 
278 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4293  integrase catalytic subunit  65.03 
 
 
188 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.942529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  52.54 
 
 
275 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  52.54 
 
 
275 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  52.54 
 
 
275 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  52.12 
 
 
275 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  52.12 
 
 
275 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2538  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2543  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.66662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2322  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3616  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623874  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3282  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2305  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  52.61 
 
 
287 aa  238  6e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  52.61 
 
 
287 aa  238  6e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  52.61 
 
 
287 aa  238  6e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3056  IS3 family transposase  51.53 
 
 
246 aa  237  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
240 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2298  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
240 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3303  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
239 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
240 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.18686e-06  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  50 
 
 
266 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2390  integrase catalytic subunit  52.54 
 
 
240 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.433388  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  51.05 
 
 
405 aa  231  7e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  51.05 
 
 
405 aa  231  7e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  51.05 
 
 
405 aa  231  7e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  51.05 
 
 
405 aa  231  7e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.99594e-06  hitchhiker  1.66407e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>