42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0729 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  74.39 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  74.83 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  74.14 
 
 		 290 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  74.48 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.14 
 
 		 290 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  72.07 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  73.45 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  73.45 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  73.79 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  73.61 
 
 		 291 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  72.07 
 
 		 290 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  69.9 
 
 		 291 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  64.08 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  63.89 
 
 		 291 aa  363  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  65.05 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  54.67 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  53.47 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  51.39 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  36.54 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  37.67 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  32.99 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  36.24 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  30.98 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  33.56 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.91 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  29.93 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  29.47 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  28.72 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  28.72 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  28.93 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  26.62 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  31.19 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  25.17 
 
 		 332 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  29.46 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.61 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  28.8 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>