250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0320 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0320  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  90.14 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  87.32 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4567  orotate phosphoribosyltransferase  86.85 
 
 		 213 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000210498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3843  orotate phosphoribosyltransferase  87.32 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  86.38 
 
 		 215 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0353  orotate phosphoribosyltransferase  86.85 
 
 		 215 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  86.38 
 
 		 215 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  85.92 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  85.45 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  85.92 
 
 		 213 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  84.98 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  84.98 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  84.98 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  84.98 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  81.22 
 
 		 213 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  83.57 
 
 		 213 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0154  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  350  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  78.4 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  77.93 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 213 aa  348  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 213 aa  348  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 214 aa  347  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 213 aa  347  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 213 aa  347  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 215 aa  346  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 215 aa  346  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 215 aa  346  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04047  orotate phosphoribosyltransferase  76.53 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  77 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 213 aa  344  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4846  orotate phosphoribosyltransferase  78.87 
 
 		 213 aa  344  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116277  decreased coverage  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  77.93 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  76.53 
 
 		 213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  73.76 
 
 		 221 aa  340  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3964  orotate phosphoribosyltransferase  75.59 
 
 		 213 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4281  orotate phosphoribosyltransferase  74.65 
 
 		 217 aa  327  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  70.7 
 
 		 215 aa  311  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5291  orotate phosphoribosyltransferase  69.95 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.488718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5340  orotate phosphoribosyltransferase  69.95 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.161962  hitchhiker  0.00942663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5199  orotate phosphoribosyltransferase  69.95 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0181  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0223943  hitchhiker  0.00000686039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02880  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6107  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70370  orotate phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0108  orotate phosphoribosyltransferase  67.14 
 
 		 213 aa  288  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0895164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5544  orotate phosphoribosyltransferase  67.76 
 
 		 214 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4383  orotate phosphoribosyltransferase  67.61 
 
 		 213 aa  286  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101877 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0181  orotate phosphoribosyltransferase  61.97 
 
 		 213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  62.91 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2998  orotate phosphoribosyltransferase  58.88 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  60.39 
 
 		 214 aa  261  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3672  orotate phosphoribosyltransferase  60.09 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.145212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0206  orotate phosphoribosyltransferase  77.64 
 
 		 169 aa  258  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  57.35 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3204  orotate phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  56.87 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  53.99 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  51.6 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  51.6 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  52.34 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0521  orotate phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 		 224 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.00908812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 		 223 aa  214  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1724  orotate phosphoribosyltransferase  53.24 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.286462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0217  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1206  orotate phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03730  orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5)  49.3 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>