More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2135 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 596 aa  1234    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 		 640 aa  339  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 		 624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 648 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  30.81 
 
 		 614 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  30.87 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  25.76 
 
 		 615 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  30.6 
 
 		 310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.52 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 		 324 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 		 308 aa  134  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  32.69 
 
 		 320 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 		 320 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 324 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 		 332 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 307 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  28.33 
 
 		 307 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 307 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  28.29 
 
 		 328 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 323 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 307 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 		 318 aa  124  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 		 323 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.28 
 
 		 323 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31 
 
 		 343 aa  123  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.33 
 
 		 305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.59 
 
 		 326 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  27.67 
 
 		 307 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  26.49 
 
 		 293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  28.32 
 
 		 363 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.38 
 
 		 350 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  31.07 
 
 		 328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  31.07 
 
 		 328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  29.8 
 
 		 360 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.47 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  38.2 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  29.05 
 
 		 367 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.04 
 
 		 345 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  28.22 
 
 		 308 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  30.21 
 
 		 361 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  29.05 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  29.51 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  29.49 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  26.03 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  30.21 
 
 		 349 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  26.76 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  35.15 
 
 		 460 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  27.79 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  35.35 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  36.61 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  29.34 
 
 		 369 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.22 
 
 		 316 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  29.15 
 
 		 349 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  28.36 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.34 
 
 		 341 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.22 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  28.65 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  25.42 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  26.17 
 
 		 296 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  26.17 
 
 		 296 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.26 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  28.29 
 
 		 365 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  34.34 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  28.28 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  26.96 
 
 		 355 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  34.36 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  27.44 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.71 
 
 		 316 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.71 
 
 		 319 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  29.57 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.71 
 
 		 316 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  29.39 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.82 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  28.06 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.39 
 
 		 316 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  26.67 
 
 		 356 aa  103  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  28.71 
 
 		 328 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  28.66 
 
 		 347 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  29.63 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  29.08 
 
 		 383 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  27.78 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  27.53 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  26.5 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  33.15 
 
 		 379 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  26.97 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  28.75 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.72 
 
 		 316 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>