More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2062 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  82.35 
 
 
374 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  82.35 
 
 
374 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  100 
 
 
374 aa  790    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.47 
 
 
374 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  99.73 
 
 
374 aa  788    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.2 
 
 
374 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  82.35 
 
 
374 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.52 
 
 
373 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  71.58 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  49.03 
 
 
373 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  40.51 
 
 
380 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2455  Rieske (2Fe-2S) protein  34.4 
 
 
388 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.64 
 
 
360 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0529  Rieske (2Fe-2S) protein  32.04 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3019  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.866348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.24 
 
 
362 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
362 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.08 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.8 
 
 
377 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  28.04 
 
 
380 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
385 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
373 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.45 
 
 
403 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  28.84 
 
 
385 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.84 
 
 
385 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  28.37 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  29.51 
 
 
393 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.71 
 
 
369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.71 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  27.72 
 
 
374 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.05 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  37.19 
 
 
376 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  25.68 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 
384 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.71 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.37 
 
 
385 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  28.18 
 
 
396 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  26.56 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.5 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  33.5 
 
 
429 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  33.5 
 
 
429 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  33.33 
 
 
410 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  28.07 
 
 
434 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.66 
 
 
430 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.8 
 
 
414 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  31.78 
 
 
432 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  31.66 
 
 
430 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  28.42 
 
 
393 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.2 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.1 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.65 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.99 
 
 
430 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.5 
 
 
430 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
430 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.67 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.1 
 
 
437 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  29.92 
 
 
384 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.42 
 
 
421 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
413 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  34.62 
 
 
414 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  28.45 
 
 
401 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  33.66 
 
 
445 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.1 
 
 
413 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.51 
 
 
412 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.55 
 
 
355 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.86 
 
 
427 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  35.07 
 
 
413 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.01 
 
 
418 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  32.41 
 
 
408 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.17 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.8 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.49 
 
 
426 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.66 
 
 
410 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  34.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.6 
 
 
413 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.96 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  33.33 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  33.33 
 
 
437 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.38 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.87 
 
 
413 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.87 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.87 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.87 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.5 
 
 
487 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2803  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.03 
 
 
366 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2170  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2143  hypothetical protein  26.65 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  31.63 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>