25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_0039 on replicon NC_010657
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  100 
 
 		 364 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1484  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  37.99 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  40.26 
 
 		 335 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0099  pilx6 protein  37.09 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0519524  normal  0.478 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0034  cmgB6  24.25 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a014  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  26.16 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0178  hypothetical protein  19.62 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.12 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  22.03 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  23.29 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  23.29 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  20.79 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0859  VirB6 family type IV secretion system protein  24.27 
 
 		 1149 aa  53.1  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  25.67 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  20.55 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  21.61 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.61 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.95 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  37.1 
 
 		 795 aa  49.3  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.06 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.64 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.06 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  23.04 
 
 		 1169 aa  42.7  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  22.71 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>