12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1484 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1484  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 342 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  43.02 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  37.99 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0099  pilx6 protein  31.98 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0519524  normal  0.478 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a014  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  23.13 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0034  cmgB6  22.63 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.78 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0178  hypothetical protein  22.18 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  36 
 
 		 795 aa  47.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.19 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.19 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.02 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>