43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4783 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1058    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  40.1 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  42.56 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  36.31 
 
 		 594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  38.28 
 
 		 579 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  38.28 
 
 		 579 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  38.28 
 
 		 579 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  39.2 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  38.99 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  40.1 
 
 		 572 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  38.04 
 
 		 591 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  37.62 
 
 		 607 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  35.57 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  33.76 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  32.83 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  33.95 
 
 		 516 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  30.08 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  30.08 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  30.08 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  33.68 
 
 		 563 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  33.04 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  37.57 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  32.46 
 
 		 518 aa  146  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.52 
 
 		 505 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  31.81 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  32.56 
 
 		 551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  36.43 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  31.93 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  31.55 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.13 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  33.65 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  35.33 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  34.39 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  30.71 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  42.94 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  38.1 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  41.24 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  37.84 
 
 		 592 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  28.92 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  27.27 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  32.62 
 
 		 551 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  28.68 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>