42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0188 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
211 aa  417  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  77.51 
 
 
210 aa  291  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  60.09 
 
 
214 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  53.93 
 
 
212 aa  214  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  56.92 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  59.26 
 
 
183 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  52.66 
 
 
218 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  54.46 
 
 
214 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  51.43 
 
 
211 aa  194  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  52.69 
 
 
211 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  47.42 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  51.35 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  54.69 
 
 
181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  51.14 
 
 
220 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  53.85 
 
 
197 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  48.57 
 
 
201 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  42.86 
 
 
223 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  48.98 
 
 
223 aa  154  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  49.73 
 
 
190 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  43.65 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  42.39 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  42.78 
 
 
241 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  39.31 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  40.22 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  46.67 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  39.41 
 
 
225 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  37.21 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  40.67 
 
 
258 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  31.84 
 
 
215 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 
247 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  35.22 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  27.27 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  36.17 
 
 
139 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  27.91 
 
 
151 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  30.33 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  31.73 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3639  Vitamin K epoxide reductase  33.1 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.958294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  31.25 
 
 
125 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  27.66 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>