More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2634 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1268    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  44.77 
 
 		 605 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  44.28 
 
 		 605 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  45.19 
 
 		 662 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  54.48 
 
 		 266 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  51.81 
 
 		 390 aa  279  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  46.74 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  43.57 
 
 		 280 aa  231  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  43.48 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  43.12 
 
 		 369 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.22 
 
 		 370 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.22 
 
 		 370 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  43.12 
 
 		 367 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  43.12 
 
 		 367 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  42.3 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  41.9 
 
 		 369 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  41.9 
 
 		 369 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  42.52 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  41.59 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  41.9 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  41.9 
 
 		 369 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.13 
 
 		 366 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  44.4 
 
 		 369 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  44.04 
 
 		 369 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  44.4 
 
 		 369 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  44.04 
 
 		 369 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  44.04 
 
 		 369 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  44.93 
 
 		 268 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  42.75 
 
 		 268 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  42.39 
 
 		 268 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  40.57 
 
 		 269 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  40.81 
 
 		 267 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  37.72 
 
 		 269 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  42.96 
 
 		 267 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  42.59 
 
 		 267 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  41.48 
 
 		 267 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  41.85 
 
 		 267 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  38.46 
 
 		 268 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  40.68 
 
 		 287 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.85 
 
 		 381 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.88 
 
 		 361 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  34.69 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  34.66 
 
 		 379 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.05 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.23 
 
 		 367 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.84 
 
 		 380 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.58 
 
 		 387 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.25 
 
 		 406 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.44 
 
 		 375 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.55 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.55 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  31.55 
 
 		 373 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  32.72 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.94 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.89 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.36 
 
 		 371 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  36.57 
 
 		 263 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.96 
 
 		 380 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  34.93 
 
 		 265 aa  157  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.56 
 
 		 374 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  32.26 
 
 		 351 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.49 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.63 
 
 		 383 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.23 
 
 		 356 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  34.15 
 
 		 291 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  38.08 
 
 		 272 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  31.64 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  36.76 
 
 		 266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  32.67 
 
 		 676 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  32.29 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.46 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  35.61 
 
 		 293 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.95 
 
 		 382 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  38.93 
 
 		 272 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.95 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.66 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.16 
 
 		 713 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  30.95 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.95 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.95 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.66 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.13 
 
 		 363 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.53 
 
 		 386 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.15 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  33.7 
 
 		 264 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  34.04 
 
 		 275 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  30.64 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  29.25 
 
 		 368 aa  144  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.02 
 
 		 681 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.73 
 
 		 682 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.26 
 
 		 381 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.26 
 
 		 380 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.08 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.79 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.97 
 
 		 380 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.57 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>