122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1571 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  86.69 
 
 		 264 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  86.69 
 
 		 264 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  86.31 
 
 		 264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  85.93 
 
 		 264 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  85.55 
 
 		 264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  85.17 
 
 		 264 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  84.79 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  84.41 
 
 		 264 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  84.41 
 
 		 264 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  83.86 
 
 		 264 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  82.44 
 
 		 262 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  67.05 
 
 		 262 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  61.92 
 
 		 259 aa  345  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  65.15 
 
 		 266 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  60.08 
 
 		 259 aa  331  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  60.98 
 
 		 263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  66.39 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  63.85 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  63.45 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  67.89 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  61.04 
 
 		 267 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  67.8 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  68.07 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  70.13 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  57.79 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  60.73 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  69.7 
 
 		 248 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  55.73 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  58.68 
 
 		 272 aa  301  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  58.17 
 
 		 327 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  56.68 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  58.17 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  59.76 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  60.56 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  59.76 
 
 		 260 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  60.56 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  60.16 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  55.77 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  59.76 
 
 		 260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  59.76 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  59.76 
 
 		 260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  59.5 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  59.09 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  56.3 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  58.02 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  55.38 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  57.31 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  56.92 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  56.5 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  55.56 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  59.63 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  59.63 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  51.26 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  48.91 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  44.17 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  42.13 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  42.74 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  40.43 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  38.63 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  40.79 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  44.21 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  42.92 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  43.35 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  42.37 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  36.32 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  35.74 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  34.47 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  34.47 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  35.29 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  32.6 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  32.76 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  32.37 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  32.88 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  33.74 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  30.36 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.47 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  32.93 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  35.58 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  34.41 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  31.65 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  32.64 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  32.73 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  32.22 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  29.06 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  30.47 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  32.33 
 
 		 231 aa  92.8  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  33.65 
 
 		 227 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  32.54 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  31.88 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  32.56 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  32.61 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  32.61 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  29.96 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  31.31 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  29.46 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>