37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0076 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  73.41 
 
 		 816 aa  1285    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  73.65 
 
 		 816 aa  1282    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  73.68 
 
 		 818 aa  1295    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  90.95 
 
 		 829 aa  1580    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  57.23 
 
 		 684 aa  778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  91.19 
 
 		 829 aa  1583    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  91.31 
 
 		 829 aa  1583    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  73.29 
 
 		 816 aa  1281    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1715    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  24.6 
 
 		 770 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  24.88 
 
 		 769 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.42 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  25.88 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.06 
 
 		 769 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  26.64 
 
 		 770 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  25.87 
 
 		 770 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  25.87 
 
 		 770 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  27.27 
 
 		 770 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  23.79 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.17 
 
 		 768 aa  54.7  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  26.28 
 
 		 291 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  28.1 
 
 		 566 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  28.1 
 
 		 566 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  23.12 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  25.39 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.81 
 
 		 566 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  26 
 
 		 566 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  22.04 
 
 		 300 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.81 
 
 		 566 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.41 
 
 		 449 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  25.81 
 
 		 332 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  39.71 
 
 		 691 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.4 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  28.67 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  27.97 
 
 		 720 aa  44.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>