40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2014 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  888    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  33.7 
 
 
458 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  34 
 
 
437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  32.67 
 
 
445 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  22.76 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  25.83 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  29.84 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  29.3 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  23.26 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  23.84 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  34.06 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  23.84 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  27.63 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  30.89 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  25.18 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  28.57 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  26.88 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  33.6 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  28.3 
 
 
400 aa  57.4  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  34.71 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  30.3 
 
 
425 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  32.5 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  20.05 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  32.45 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  26.92 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  32.33 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  25.76 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  33.06 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1824  DNA repair ATPase  25.59 
 
 
495 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3170  putative abortive phage resistance  25.12 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  31.71 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  30.41 
 
 
426 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  30.33 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  22.19 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  52 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  29.13 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  31.3 
 
 
368 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  21.96 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  50 
 
 
985 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  23.33 
 
 
394 aa  43.5  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>