More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2152 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  374  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  68.15 
 
 		 279 aa  368  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  68.12 
 
 		 276 aa  367  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 276 aa  364  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 275 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  67.03 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  361  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.87 
 
 		 277 aa  361  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  65.31 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 273 aa  348  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 275 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 275 aa  344  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 277 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 274 aa  338  8e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 275 aa  331  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  65.11 
 
 		 278 aa  331  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  63.93 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 		 280 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 281 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  63.8 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  60.15 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17130  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.411927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  59.34 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  63.6 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  58.57 
 
 		 287 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  58.57 
 
 		 287 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  63.6 
 
 		 279 aa  325  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 273 aa  324  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 277 aa  324  8.000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 273 aa  324  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 273 aa  324  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  62.5 
 
 		 278 aa  323  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 276 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  59.41 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  61.43 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  63.08 
 
 		 280 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  62.14 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>