More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1134 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  100 
 
 		 472 aa  959    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  51.78 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  53.32 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  53.44 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.68 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  53.76 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  53.47 
 
 		 453 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  50.79 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  52.02 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  49.56 
 
 		 455 aa  435  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  51.22 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  50.56 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  50.45 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  48.37 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  48.26 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  48.21 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  47.54 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  49.55 
 
 		 454 aa  415  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  46.33 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  48.34 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  45.91 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  47.01 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  50.33 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  48.79 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  49.22 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  47.69 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  46.68 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  46.77 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  47.29 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.2 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.2 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  46.98 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  45.36 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  46.53 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  45.23 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  45.31 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  48.06 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  48.57 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  49.87 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.19 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  45.23 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  45.07 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  47.46 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  46.21 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  44.47 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  43.39 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  42.92 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  40.93 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  42.13 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  41.89 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  43.18 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  42.57 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  41.52 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  45.14 
 
 		 592 aa  350  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  42.95 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  41.59 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  42.99 
 
 		 454 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  41.26 
 
 		 461 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  42.57 
 
 		 813 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  41.7 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  41.61 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  40.36 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  40.97 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  41.19 
 
 		 457 aa  340  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  42.67 
 
 		 448 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  41.5 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  41.28 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  41.28 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  40.53 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  40.53 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  41.06 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  40.31 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  40.31 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  39.87 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  41.06 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  40.31 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  41.31 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  40.09 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  40.31 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  40.62 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  40.31 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  43.56 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  39.43 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  39.21 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  39.43 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  39.96 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  38.46 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  40.17 
 
 		 486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  39.38 
 
 		 493 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  38.17 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  40.09 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  39.78 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  39.37 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  39.3 
 
 		 487 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  37.83 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  36.95 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.84 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  41.94 
 
 		 458 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  40.18 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>