More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0375 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
385 aa  769    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  64.49 
 
 
395 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  61.62 
 
 
398 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.21 
 
 
409 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.69 
 
 
395 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.01 
 
 
404 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.1 
 
 
393 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.03 
 
 
394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  58.55 
 
 
407 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.14 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.96 
 
 
453 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  48.04 
 
 
454 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
399 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  45.95 
 
 
453 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  51.55 
 
 
461 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.74 
 
 
402 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 
400 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.91 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
404 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.83 
 
 
401 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.56 
 
 
386 aa  346  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.44 
 
 
392 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.52 
 
 
414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
400 aa  332  5e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.17 
 
 
402 aa  332  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.79 
 
 
392 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.01 
 
 
399 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.53 
 
 
442 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.14 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.01 
 
 
396 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  45.08 
 
 
382 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.81 
 
 
384 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.13 
 
 
392 aa  322  6e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.13 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.75 
 
 
466 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.23 
 
 
387 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.09 
 
 
392 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  42.82 
 
 
392 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.98 
 
 
387 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.72 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.3 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.45 
 
 
386 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.45 
 
 
387 aa  311  9e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.85 
 
 
393 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  44.59 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.3 
 
 
392 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.19 
 
 
386 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.34 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.98 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  42.23 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.67 
 
 
415 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  42.86 
 
 
404 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5095  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.27 
 
 
409 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.0779135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.13 
 
 
408 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0549  glutaryl-CoA dehydrogenase  42.41 
 
 
393 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  42.41 
 
 
393 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.86 
 
 
386 aa  299  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  41.97 
 
 
394 aa  299  6e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1037  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.72 
 
 
396 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.12 
 
 
404 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.93 
 
 
393 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017739  normal  0.388373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  42.82 
 
 
385 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  42.82 
 
 
385 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  43.23 
 
 
404 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  43.7 
 
 
408 aa  298  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.78 
 
 
398 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.67 
 
 
393 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  hitchhiker  0.0000982042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0177  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.67 
 
 
393 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00130576  normal  0.936713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.78 
 
 
385 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5068  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.41 
 
 
393 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000324963  normal  0.0231586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.49 
 
 
397 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
389 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.78 
 
 
396 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.15 
 
 
392 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0167364  normal  0.43046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  42.74 
 
 
395 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.08 
 
 
404 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.08 
 
 
395 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.8 
 
 
389 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0117  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.15 
 
 
393 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0899419  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.82 
 
 
404 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0805  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  42.23 
 
 
397 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  42.04 
 
 
422 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.19 
 
 
391 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.46 
 
 
409 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  44.24 
 
 
391 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.31 
 
 
396 aa  292  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
413 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.13 
 
 
376 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.13 
 
 
376 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1193  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.24 
 
 
394 aa  292  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.53 
 
 
399 aa  292  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.360682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.73 
 
 
408 aa  291  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0772  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.71 
 
 
397 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.268888  normal  0.15145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  42.3 
 
 
395 aa  291  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.34 
 
 
397 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  44.13 
 
 
396 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0776  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.6 
 
 
396 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.567358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.3 
 
 
404 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>