297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3472 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  361  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  91.85 
 
 
319 aa  267  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  91.85 
 
 
319 aa  267  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  91.85 
 
 
319 aa  267  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  91.85 
 
 
319 aa  267  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  70.59 
 
 
321 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  195  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
316 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  67.41 
 
 
327 aa  193  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  67.41 
 
 
316 aa  193  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  67.65 
 
 
153 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  50.28 
 
 
330 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  56.46 
 
 
355 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  56.46 
 
 
348 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  60.61 
 
 
277 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  50.28 
 
 
330 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  50 
 
 
330 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  50 
 
 
330 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  50 
 
 
330 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  54.97 
 
 
463 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  78.22 
 
 
128 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  53.49 
 
 
320 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  51.47 
 
 
321 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
316 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
316 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
316 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
316 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  51.13 
 
 
316 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  51.13 
 
 
316 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  52.8 
 
 
280 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  60 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  60 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  60 
 
 
286 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  60 
 
 
329 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  47.06 
 
 
320 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  48.55 
 
 
174 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  47.1 
 
 
274 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  48.55 
 
 
174 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  79.71 
 
 
83 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  51.72 
 
 
314 aa  118  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  60 
 
 
314 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  68.83 
 
 
83 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  92.31 
 
 
508 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  44.12 
 
 
216 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  51.96 
 
 
185 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  87.72 
 
 
197 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  47.96 
 
 
259 aa  97.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.68 
 
 
265 aa  94.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  67.21 
 
 
284 aa  92.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  73.58 
 
 
53 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  34.68 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 
323 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  42.22 
 
 
329 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  35.09 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  36.27 
 
 
323 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 
238 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  40.24 
 
 
323 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  34.69 
 
 
323 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  40.24 
 
 
323 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
273 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
273 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
273 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
273 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  33.77 
 
 
273 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5016  hypothetical protein  42.55 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
333 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
333 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
333 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
333 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
333 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 
321 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  34.18 
 
 
349 aa  50.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  35.29 
 
 
325 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  35.96 
 
 
325 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  30.56 
 
 
381 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
607 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  31.06 
 
 
330 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  33.33 
 
 
481 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 
341 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  32.41 
 
 
329 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 
341 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 
378 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>