More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2985 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  88.35 
 
 
424 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  100 
 
 
412 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  88.59 
 
 
424 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  71.6 
 
 
423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  68.93 
 
 
421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  70.87 
 
 
422 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  74.03 
 
 
422 aa  508  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  54.31 
 
 
441 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  57.11 
 
 
447 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  53.68 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  52.51 
 
 
442 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  54.31 
 
 
441 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  54.25 
 
 
438 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  52.61 
 
 
442 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  55.53 
 
 
435 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  54.44 
 
 
444 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  51.05 
 
 
441 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  51.88 
 
 
448 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  51.05 
 
 
441 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.17 
 
 
430 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  51.29 
 
 
441 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  49.53 
 
 
442 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  49.88 
 
 
447 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  51.64 
 
 
448 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  50.59 
 
 
441 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  49.3 
 
 
442 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  49.53 
 
 
438 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.93 
 
 
447 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  48.36 
 
 
470 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 
432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.96 
 
 
437 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  48.83 
 
 
440 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  46.03 
 
 
442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  50.85 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  46.5 
 
 
442 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  45.15 
 
 
440 aa  333  5e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  46.81 
 
 
453 aa  318  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  40.44 
 
 
429 aa  315  7e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  42.07 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  46.12 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  42.41 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  45.45 
 
 
397 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 
467 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  47.07 
 
 
443 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  41.87 
 
 
442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.55 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.62 
 
 
422 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  37.32 
 
 
412 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.41 
 
 
424 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
441 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.8 
 
 
457 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
441 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
429 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
424 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  38.33 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
425 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
428 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
435 aa  199  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 
420 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  40.71 
 
 
403 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.81 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  43.08 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 
438 aa  196  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 
433 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.14 
 
 
437 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.31 
 
 
424 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 
427 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
436 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.56 
 
 
434 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 
428 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.91 
 
 
424 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  40.55 
 
 
408 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.25 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
429 aa  190  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  35.99 
 
 
434 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  32.21 
 
 
433 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  36.98 
 
 
437 aa  189  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 
428 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.74 
 
 
422 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.14 
 
 
443 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.61 
 
 
434 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.46 
 
 
427 aa  186  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 
430 aa  186  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.18 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.72 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  36.87 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.01 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.07 
 
 
424 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  37.79 
 
 
431 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.66 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  30.64 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.64 
 
 
432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  32.13 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  30.34 
 
 
432 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  39.52 
 
 
408 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.06 
 
 
422 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>