More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1539 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  100 
 
 
160 aa  329  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  44.83 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  40.94 
 
 
152 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  45.59 
 
 
157 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  46.32 
 
 
161 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  40.27 
 
 
153 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  45.52 
 
 
149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  40.27 
 
 
152 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  45.27 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  42 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  41.38 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  41.38 
 
 
152 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  41.38 
 
 
161 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  41.89 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  41.38 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  43.07 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  41.38 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  41.38 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  37.93 
 
 
148 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  41.61 
 
 
150 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  36.55 
 
 
153 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  36.05 
 
 
156 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  36.81 
 
 
148 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  38.19 
 
 
154 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  37.67 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  38.93 
 
 
150 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  35.42 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  38.73 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  34.72 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  36.91 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 
152 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  36.49 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  37.01 
 
 
150 aa  90.9  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  38.26 
 
 
164 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  35.37 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  38.76 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
150 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  35.57 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  37.58 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  34.9 
 
 
686 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  36.91 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  36.91 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  36.91 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  37.4 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
686 aa  87.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  34.9 
 
 
177 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  36.91 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  38.89 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  34.38 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  36.15 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  36.15 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  35.4 
 
 
175 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  36.18 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  34.46 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
153 aa  84  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  35.57 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  37.04 
 
 
690 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  34.88 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  32.59 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  34.11 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  33.08 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  35.29 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
695 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  34.35 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  37.23 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.43 
 
 
679 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
682 aa  80.9  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  36.91 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  34.9 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  33.58 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  34.23 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  31.97 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  33.58 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  32 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  33.56 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  32.06 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  32.85 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  32.89 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
684 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  33.33 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  33.33 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  35.54 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  32.65 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  33.56 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  32.89 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  32.89 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  31.29 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  35.54 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>