More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4919 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  76.43 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  46.58 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  41.84 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  43.11 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  45.16 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  45.14 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  44.71 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  44.8 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  45.04 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.8 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  45.52 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  44.68 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  44.09 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  44.52 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  44.18 
 
 		 305 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  46.07 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  44.6 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  43.92 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  43.01 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  44.86 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  43.17 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  42.81 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  40.43 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  44.79 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  39.78 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.97 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  39.22 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  42.72 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  42 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  42 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  39.54 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  32.62 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  27.53 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.39 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.48 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.5 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 310 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  31.07 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.42 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  30.14 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.51 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  32.16 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.02 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.07 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  33.81 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.5 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.62 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.82 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.51 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  31.34 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  31.56 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  28.67 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.27 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  28.83 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.4 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.4 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.17 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.05 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.4 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  28.31 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  27.21 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.4 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  28 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>