More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1426 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 332 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  96.99 
 
 		 332 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  86.22 
 
 		 377 aa  567  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  73.19 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  76.64 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  60.71 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  63.11 
 
 		 345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  62.3 
 
 		 345 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  61.54 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  61.54 
 
 		 339 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  60.58 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  58.2 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  61.22 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  60.9 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  60.69 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  61.01 
 
 		 339 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  57.14 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  54.63 
 
 		 329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  54.24 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  51.99 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  55.14 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  50.9 
 
 		 345 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  50.6 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  51.67 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  51.98 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  53.29 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  51.43 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  50.31 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  51.96 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  50.75 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  50.82 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  47.26 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  46.99 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  48.8 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  48.85 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  47.32 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  42.77 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  48.5 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  41.96 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  41.72 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  48.44 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  44.01 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  44.24 
 
 		 339 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  50.16 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  53.41 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  53.82 
 
 		 421 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  47.87 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  53.41 
 
 		 406 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  47.54 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  51.81 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  42.68 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  50 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  44.07 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  46.2 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  49.8 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  43.56 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  42.3 
 
 		 343 aa  261  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  43.67 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  42.22 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  42.32 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  42.99 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  42.39 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  49.4 
 
 		 393 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  41.34 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  42.43 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  41.23 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  39.27 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  39.16 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  42.95 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  44.18 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 		 341 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  45.45 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  47.24 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  42.77 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  40.12 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  41.21 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  39.81 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  45.08 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  38.22 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  41.27 
 
 		 312 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  41.69 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  41.42 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  39.35 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  41.04 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  39.05 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  39.05 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>