More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4124 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  93.3 
 
 		 448 aa  831    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  100 
 
 		 448 aa  906    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  73.44 
 
 		 447 aa  670    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  70.54 
 
 		 446 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  48.36 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  47.66 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  43.02 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  42.57 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  43.5 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  41.44 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  46.98 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  42.83 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  41.44 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  41.81 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  45.84 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  41.8 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  41.78 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  44.07 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  43.62 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  45.09 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  41.94 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  42.6 
 
 		 450 aa  359  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  41.02 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  41.57 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  41.34 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  40.13 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  42.49 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  41.02 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  41.02 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  40.8 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  40.88 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  41.34 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  41.11 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  41.11 
 
 		 454 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  40.88 
 
 		 456 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  40.88 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  41.11 
 
 		 456 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  40.88 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  40.8 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  42.83 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  45.31 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  42.06 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  41.94 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  41.87 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  41.12 
 
 		 449 aa  345  7e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  40.58 
 
 		 813 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  43.49 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  38.94 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  41.03 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  38.94 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  38.94 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  41.63 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  39.38 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  39.74 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  38.89 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  43.56 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.7 
 
 		 455 aa  338  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  44.1 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  41.27 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  40.71 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  39.5 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  39.5 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  39.5 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  43.75 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  40.27 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.7 
 
 		 452 aa  332  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  42.86 
 
 		 449 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  45.23 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  40.17 
 
 		 467 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  44.07 
 
 		 453 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  41.18 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  40.58 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  41.57 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  37.7 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  39.28 
 
 		 451 aa  325  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  37.32 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  40.86 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  42.13 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  41.39 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  37.29 
 
 		 486 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  41.81 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  37.42 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  43.58 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  39.91 
 
 		 456 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  41.39 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.95 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  40 
 
 		 529 aa  308  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  39.37 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  40.56 
 
 		 475 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  42.07 
 
 		 454 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.09 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  41.26 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  40.43 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  34.49 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  39.75 
 
 		 491 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  35.1 
 
 		 493 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  40.38 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.62 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.62 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>