153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4113 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 424 aa  861    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  86.56 
 
 		 424 aa  749    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  46.42 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  45.5 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  45.73 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  44.32 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  44.68 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  42.13 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  45.48 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  43.06 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  42.82 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  42.82 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  42.59 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  42.82 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  42.82 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  42.82 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  42.59 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  42.36 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  42.59 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  42.59 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  40.14 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  42.07 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  40 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  45 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  44.1 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  41.06 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  40.7 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  41.53 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  41.39 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  39.95 
 
 		 451 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  38.44 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  38.13 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  38.22 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  38.13 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  37.9 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  37.9 
 
 		 450 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  37.9 
 
 		 450 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  37.99 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  37.27 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  37.27 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  36.99 
 
 		 451 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  37.05 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  37.05 
 
 		 451 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  33.96 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  33.41 
 
 		 427 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.82 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  29.52 
 
 		 459 aa  209  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  30.66 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  33.02 
 
 		 410 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  30.26 
 
 		 447 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  32.81 
 
 		 460 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  30.47 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  31.07 
 
 		 453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  31.68 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  31.18 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  27.69 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.95 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.18 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  29.12 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  27.95 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  27.95 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.73 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  28.61 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.52 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  27.51 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  31.55 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.77 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  27.19 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  31 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  27.94 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  27.48 
 
 		 489 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 468 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  25.84 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  26.39 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.77 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  30.35 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  29.72 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  29.16 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  26.36 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.59 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.83 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  27.21 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  27.21 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  27.21 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  26.99 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  26.99 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  24.94 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  24.94 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>