More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4008 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4008  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0673  histone family protein DNA-binding protein  96.7 
 
 		 92 aa  177  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  88.89 
 
 		 91 aa  159  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4202  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 94 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  52.81 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  50.55 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  50.56 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  51.76 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  52.22 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649518  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  52.22 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  51.09 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  49.45 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  47.19 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0180  histone family protein DNA-binding protein  54.65 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000456063  normal  0.670354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  48.91 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  47.19 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3758  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.639339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>